Veškeré suroviny a zboží, které se používá ve skladech, musí být definované jako skladové položky. Při práci se skladovými položkami se často pracuje s hodnotou nazvanou koeficient odpadu, která zachycuje rozdíl mezi hrubou a čitou váhou - např. při škrábání brambor. V závislosti na nastavení systému je možné, aby se při zadání položky dodacího listu automaticky aktualizovala skladová cena. Skladové položky je možné, pro pozdější analýzy, členit ve třech nezávislých skupinách. Septim umožňuje rozlišovat skladové položky hlavní i vedlejší. Takové rozdělení řeší problémy s přepočty při naskladňování stejného zboží v různých baleních (například Becherovka 0.7l, Becherovka 0.5l, atp).
Velice užitečnou funkcí pro optimalizaci množství zboží na skladu je evidence tzv. minimálních a kritických zásob jednotlivých skladových položek pro konkrétní sklad. Minimální a kritické zásoby se uplatňují i při „fasování zboží“ na střediska. Protože k odtěžování skladů dochází v okamžiku namarkování, existuje nejenom průběžnou kontrolu, ale je možné zablokovat prodej receptury, na jejíž přípravu nejsou ve skladu suroviny.
Seznam všech skladových položek je možné řadit a filtrovat podle zvolených parametrů.